基于叶绿体DNA rps16序列的福建泰宁野生铁皮石斛多样性分析

doi:10.19303/j.issn.1008-0384.2016.08.008

福建农业学报 ›› 2016, Vol. 31 ›› Issue (8): 833-838.doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2016.08.008

基于叶绿体DNA rps16序列的福建泰宁野生铁皮石斛多样性分析

曹奕鸯, 江金兰, 李永清, 雷伏贵, 叶炜

福建省三明市农业科学研究院药用植物研究所, 福建沙县 365051

收稿日期:2016-04-05 修回日期:2016-05-12 出版日期:2016-08-28 发布日期:2016-08-28
通讯作者: 叶炜(1980-),男,博士,副研究员,研究方向:园艺植物生物技术(E-mail:yewei922@qq.com) E-mail:yewei922@qq.com
作者简介:曹奕鸯(1984-),男,硕士,助理研究员,研究方向:药用植物资源与利用(E-mail:caoyiyang@yeah.net)
基金资助:
国家星火计划项目（2014GA720032）；福建省种业创新与产业化工程项目（FJZZZX-1540）；福建省三明市科技计划项目（2014-N-3）

Diversity Analysis Based on Chloroplast DNA rps16 Sequence for Wild Dendrobium officinale from Taining, Fujian

CAO Yi-yang, JIANG Jin-lan, LI Yong-qing, LEI Fu-gui, YE Wei

Institute of Medicinal Plants, Sanming Academy of Agricultural Science, Shaxian, Fujian 365051, China

Received:2016-04-05 Revised:2016-05-12 Online:2016-08-28 Published:2016-08-28

摘要/Abstract

摘要： 为了解福建泰宁野生铁皮石斛种源的多样性，对75份泰宁野生铁皮石斛及其他石斛属药用植物叶绿体DNA rps16序列进行分析。结果表明：75份石斛属药用植物种间平均遗传距离为0.006 6，泰宁野生铁皮石斛种内平均遗传距离为0.00 06。38份泰宁野生铁皮石斛叶绿体DNA rps16序列比对后，共得到5个多态性位点，多态性位点数占总数的25%，种内基于K-2P遗传距离最大为0.003 4，表明泰宁野生铁皮石斛叶绿体DNA rps16序列变异较大，多样性较高。此外，在泰宁野生铁皮石斛的5种rps16核苷酸序列中，T2型、T65型、D5型为参比铁皮石斛种质中的独有类型。

关键词: 铁皮石斛, 叶绿体DNA, rps16序列

Abstract: A diversity analysis based upon the rps16 sequence of chloroplast DNA for the wild Dendrobium officinale found in Taining, Fujian and other areas was conducted. The results indicated an average genetic distance among 75 species of Dendrobium to be 0.006 6, and 0.000 6 for those from Taining. There were 5 polymorphic sites (i.e., 25% of the total) detected in the 38 wild D. officinale from Taining. The maximal genetic distance calculated by K-2P was 0.003 4, indicating significant sequence variations and high diversities among the Taining species.In addition, among the 5 different types of rps16 sequence,T2, T65, and D5 were found only in D. officinale collected from Taining.

Key words: Dendrobium officinale, chloropast DNA, rps16 sequence

中图分类号:

S567

曹奕鸯, 江金兰, 李永清, 雷伏贵, 叶炜. 基于叶绿体DNA rps16序列的福建泰宁野生铁皮石斛多样性分析[J]. 福建农业学报, 2016, 31(8): 833-838.

CAO Yi-yang, JIANG Jin-lan, LI Yong-qing, LEI Fu-gui, YE Wei. Diversity Analysis Based on Chloroplast DNA rps16 Sequence for Wild Dendrobium officinale from Taining, Fujian[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2016, 31(8): 833-838.

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基于叶绿体DNA rps16序列的福建泰宁野生铁皮石斛多样性分析

Diversity Analysis Based on Chloroplast DNA rps16 Sequence for Wild Dendrobium officinale from Taining, Fujian

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